辣椒炭疽病主要为害果实、叶片，果梗也可受害。果实染病初为水渍状黄褐色圆斑，边缘褐色，中央灰褐色，斑面有隆起的同心轮纹，往往由许多小点集成，小点有时为黑色，有时呈橙红色。潮湿时，病斑表面溢出红色黏稠物，被害果内部组织半软腐，易干缩，致病部呈膜状，有的破裂。叶片染病，初为褪绿水渍状斑点，后渐变为褐色，中间淡灰色，近圆形，其上轮生小点。果梗被害生褐色凹陷斑，病斑不规则，干燥时往往开裂。在田间还有一种病果，症状与上述相似，但组成轮纹的小点较大、较黑，一般称其为甜椒黑点炭疽病。
辣椒炭疽病:果实染病，先出现湿润状、褐色椭圆形或不规则形病斑，稍凹陷，斑面出现明显环纹状的橙红色小粒点，后转变为黑色小点，此为病菌的分生孢子盘。天气潮湿时溢出淡粉红色的粒状粘稠状物，此为病菌的分生孢子团。天气干燥时，病部干缩变薄成纸状且易破裂。叶片染病多发生在老熟叶片上，产生近圆形的褐色病斑，亦产生轮状排列的黑色小粒点，严重时可引致落叶。茎和果梗染病，出现不规则短条形凹陷的褐色病斑，干燥时表皮易破裂。
果实染病，先出现湿润状、褐色椭圆形或不规则形病斑，稍凹陷，斑面出现明显环纹状的橙红色小粒点，后转变为黑色小点，此为病菌的分生孢子盘。叶片染病多发生在老熟叶片上，产生近圆形的褐色病斑，亦产生轮状排列的黑色小粒点，严重时可引致落叶。茎和果梗染病，出现不规则短条形凹陷的褐色病斑，干燥时表皮易破裂。