初期果面上出现淡褐色小圆斑，迅速扩大，呈褐色或深褐色，表面下陷，果肉腐烂呈漏斗形，可烂至果心，具苦味。
该病主要为害果实，近成熟的果实受害严重。发病初期，果面出现淡褐色水浸状小圆斑，并迅速扩大。果肉软腐味苦，而果心呈漏斗状变褐，表面下陷，呈深浅交替的轮纹，如环境适宜便迅速腐烂，但不显轮纹。最后全果腐烂，大多脱落，也有失水干缩成黑色僵果留于树上的。这种僵果是第二年初侵染的主要菌源之一。除为害果实外，炭疽病也会侵染果台和枝干。果台发病时，自顶部开始向下蔓延，病部呈深褐色，受害严重的果台抽不出副梢，以致干枯死亡。病菌还可在衰弱枝条的基部形成小溃疡，病部略凹陷，边缘有稍隆起的愈伤组织，皮多开裂，有时有树胶流出。
主要危害果实，也可危害枝条和果台等。果实发病初期，果面出现针头大小的淡褐色小斑点、圆形、边缘清晰。以后病斑逐渐扩大，颜色变成褐色或深褐色，表面略凹陷。由病部纵向剖开，病果肉变褐腐烂，具苦味。果表面初现淡褐色小圆斑，扩展成深褐色、边缘清晰、下陷的圆斑。病部果肉呈漏斗状向果心软腐，褐色，有苦味。
在苹果果面上出现淡褐色的圆形斑点。
苹果炭疽病的主要症状主要是危害果实。
自病斑中心剖开果实，可见果肉自果面向果心呈漏斗状变褐腐烂。病组织带有苦味。病斑边缘紫红色或黑褐色，中央凹陷，斑上黑色小点稀疏，不呈同心轮纹状排列，其下果肉局部坏死，枝干发病与果实症状相似。