辣椒疫病，叶部染病，产生暗绿色病斑，叶片软腐脱落；茎染病亦产生暗绿色病斑，引起软腐或茎枝倒折，湿度大时病部可见白霉。可以用霜脲·锰锌，霜霉威，乙磷铝·锰锌，甲霜·锰锌，烯酰吗啉，霜霉·疫净，银法利(氟菌胺.双霉威)，普力克(霜霉威盐酸盐)等加叶面肥喷雾，间隔7天连续喷施一次。辣椒根腐病，基部及维管束，病株部分枝和叶片变黄萎蔫，茎内维管束褐变，湿度大或生育后期茎基部或根茎部腐烂，用甲霜.恶霉灵加五氯.福美双或者四霉素或者咯菌腈或者枯草芽孢杆菌加生根剂灌根，间隔5天连续灌根一次。
辣椒死棵原因，主要由疫病、根腐及青枯病三种病害引起的。