1、80%炭疽福美可湿性粉剂600~800倍液+20%氟硅唑咪鲜胺800倍液。2、50%多菌灵可湿性粉剂500倍液+20%氟硅唑咪鲜胺800倍液。3、70%甲基托布津可湿性粉剂800~1000倍液。4、10%世高水分散性颗粒剂800~1000倍。隔7~10天喷一次，连续喷2~3次。
可采用农业防治，消毒育种的方式防治辣椒炭疽病。
摘除病果、病叶、病枝，降低田间湿度，加强田间管理提高植株抗性，及时用药。
发病初期摘除病叶病果，而后喷药，应掌握在雨前雨后喷药，并可采取灌根与喷雾相结合。可喷75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或50%施保功可湿性粉剂1500-2500倍液，也可喷2%武夷菌素200倍液、80%炭疽福美800倍液，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次。苗床严格用药，大田必须连续喷药，方可达到良好的防治效果。