通常从幼苗茎基开始发病，于茎基一侧出现暗褐色病斑，逐渐凹陷腐烂，严重时扩展到茎四周，最后病部缢缩呈线状，易折倒或整株萎蔫而死苗。病菌侵染根系，引起根系腐烂。
初发病时，幼苗茎部产生褐色病斑，后绕茎部扩展，最后茎部缢缩成线状，幼苗折倒。发病轻的尚可生长。病部皮层变褐缢缩，遇有天气干旱或土壤缺水时，下部叶片萎蔫，严重的枯死。
芝麻立枯病是苗期常见重要病害。初发病时，幼苗茎部产生褐色病斑，后绕茎基部扩展，最后茎部缢缩成线状,幼苗折倒。发病轻的茎秆处理可恢复。成株期受害，皮层变褐变细，病部皮层变褐缢缩，遇有天气干旱或土壤缺水时，下部叶片萎蔫，直至枯死。
选用耐渍性强的品种如阳信芝麻、临沂芝麻、黄县红芝麻、冠县芝麻、单县芝麻、博山四棱白、双丰614、中芝9号等。(2)精细整地，采用高畦栽培。(3)用种子重量0．2%的40%福美双粉剂或60%多福合剂、50%多菌灵可湿性粉剂拌种。