选择优良品种，科学管理肥水。
加强肥水管理做好病害防治。
加强田间管理，注意病虫害防治。
防治方法：种子处理。在播种前先用55℃温水浸种15分钟，捞出后立即投入冷水中浸泡6~8小时，再催芽播种。也可用40%福尔马林100倍液浸种30分钟，用清水冲洗后催芽播种，也可用种子重量0.3%的福美双可湿性粉剂拌种后播种。生长期，可用0.3%磷酸二氢钾+0.5%复硝酚钠水剂2000~3000倍液或20%吡噻菌胺悬浮剂进行叶面喷雾，促进植株生长，增强抵抗力。
选择优质品种，做好水肥管理。
南爪蔓枯病的防治方法。1.清洁田间，深翻土地，与非瓜类作物实行2-3年的轮作。2.选用抗病品种，并对种子进行浸种和种衣剂拌种处理，能有效灭杀有害南瓜蔓枯病病菌，隔离病毒感染，加强呼吸强度，提高种子发芽率。3.采用高畦栽培，另外雨季要及时排除积水。4.分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施壮瓜蒂灵，使瓜蒂增粗，强化营养定向输送量，促瓜体健康生长，增强其抗南瓜蔓枯病能力。。
可采用农业防治与化学防治相结合的方法。