可以用20%嘧菌酯1500倍喷雾防治。
(1)发病严重的地块需实行1-2年的轮作。(2)种子消毒，可用55℃温水浸种15分钟。直播种子可用种子重量0.3％的50％福美双可湿性粉剂拌种。(3)采用配方施肥技术，施足充分腐熟有机肥，增施磷、钾肥。合理灌水，雨后及时排水。(4)发病初期及时进行药剂防治，可用28％易斑净可湿性粉剂1250倍液，或50％施保功可湿性粉剂2000倍液，或70％甲基托布津可湿性粉剂800-1000倍液，或50％多菌灵可湿性粉剂500-600倍液进行全株喷雾，连续施药2-3次。
合理轮作，选用抗病品种，合理密植，科学运用肥水，合理调节温度湿度，喷施妙收、露娜森等药剂进行防治。
实行2－3年的轮作。发现病株及时清除深埋或者焚烧。黄瓜蔓枯病是土传病害，在黄瓜定植缓苗后，在植株周围地面可以用70%的代森锰锌可湿性粉剂与80%百菌清可湿性粉剂按1：1比例混合成300－400倍液喷洒地面，可以有效防治蔓枯病的发生。
也可以用甲基托布津浓液进行涂抹，早期病症能治疗。