病株率5%～40%。芝麻植株染病后，初在茎秆上出现暗绿色斑块，后变为黑褐色条斑，顶梢上常有2～3个梭形溃疡状裂缝，起初檀株顶端萎蔫，后下部叶片萎凋，呈失水状，发病轻时夜间尚可恢复，几天后不再复原，剖开根茎可见维管束变成褐色，不久蔓延至髓部，出现空洞，湿度大时有菌脓溢出，逐渐形成漆黑色晶亮的颗粒，病根变成褐色，细根腐烂。病株的叶脉出现墨绿色条斑，纵横交叉呈网状，对光观察呈透明油浸状，叶背的脉纹呈黄色波浪形扭曲突起，后病叶褶皱或变褐枯死。蒴果初呈水浸状病斑，后也变为深褐色条斑，蒴果瘦瘪，种子小不能发芽。
芝麻青枯病能够危害芝麻整个植株，从根部、叶片到蒴果都会受到青枯病的危害。茎部：危害初期，芝麻植株茎部会出现绿色的病斑，随着病害的家种，后期会变成黑色的条状病斑，茎内外有菌胶溢出，后变成黑色的颗粒。叶片：危害初期，明显可见叶脉上有墨绿色的条斑，纵横交错分布，并且在中心位置呈油渍状。随着病害的加重，叶片萎蔫程度会明显增加，后期植株会慢慢枯萎而死。蒴果：危害初期，蒴果会出现水渍状的病斑，颜色变成深褐色，随着病害的加重，病斑变成条斑，导致蒴果瘦小，籽粒不饱满，影响品质和产量。
芝麻植株染病后，初在茎秆上出现暗绿色斑块，后变为黑褐色条斑，顶梢上常有2～3个梭形溃疡状裂缝，起初檀株顶端萎蔫，后下部叶片萎凋，呈失水状，发病轻时夜间尚可恢复，几天后不再复原，剖开根茎可见维管束变成褐色，不久蔓延至髓部，出现空洞，湿度大时有菌脓溢出，逐渐形成漆黑色晶亮的颗粒，病根变成褐色，细根腐烂。病株的叶脉出现墨绿色条斑，纵横交叉呈网状，对光观察呈透明油浸状，叶背的脉纹呈黄色波浪形扭曲突起，后病叶褶皱或变褐枯死。蒴果初呈水浸状病斑，后也变为深褐色条斑，蒴果瘦瘪，种子小不能发芽。