苗期即可发病，成株发病盛期从7月底初花期开始，8月底封顶期达发病高峰。症状以叶片皱缩变黄和半边黄居多，病情严重的导致死苗，症状以萎蔫型为多。同一品种重茬地发病早，病情重，反之则轻；播种早的田块发病重于晚播田。气温对枯萎病影响较明显，适宜发病温度为20℃左右，高于30℃时病株新生叶片症状隐去，下降到27℃以下时，新生叶片可继续显现症状。盛花期以前降雨多，发病早且重；反之则轻。
病原菌以分生孢子和菌丝在种子或病株残体上越冬。种子上的菌丝可存活两年以上，病残体上分生孢子一年后仍有的存活率。分生孢子借风雨传播，进行初侵染和多次再侵染。病菌生长适温度为27-30℃。植株生长衰弱、田间湿度大时，发病较重。
茬口是影响苗期芝麻枯萎病发生的主要因素，连作地苗期枯萎病发生较重。气候因素则是影响成株期芝麻枯萎病发生的主要因素之一，在降雨量大、连续阴天、湿度大的气候条件下枯萎病会迅速发生并蔓延。另外，品种间抗病性也有差异。
茬口是影响苗期芝麻枯萎病发生的主要因素，连作地苗期枯萎病发生较重。气候因素则是影响成株期芝麻枯萎病发生的主要因素之一，在降雨量大、连续阴天、湿度大的气候条件下枯萎病会迅速发生并蔓延。