病菌主要随病残体在土中越冬。翌年春越冬病菌借助雨水、灌溉水传播，从伤口侵入，经过较长时间的潜伏和繁殖，至成株期遇高温高湿条件，向上扩展，在维管束的导管内繁殖，以致堵塞导管或细胞中毒，致使叶片萎蔫。病菌也可透过导管，进入邻近的薄壁细胞内，使茎上出现水浸状不规则病斑。当土壤温度达到20℃时，出现发病中心，25℃时出现发病高峰。久雨或大雨后转晴，气温急剧升高，病情加重。
辣椒青枯病病菌主要随病残体在土中越冬。翌年春越冬病菌借助雨水、灌溉水传播，从伤口侵入，经过较长时间的潜伏和繁殖，至成株期遇高温高湿条件，向上扩展，在维管束的导管内繁殖，以致堵塞导管或细胞中毒，致使叶片萎蔫。病菌也可透过导管，进入邻近的薄壁细胞内，使茎上出现水浸状不规则病斑。当土壤温度达到20℃时，出现发病中心，25℃时出现发病高峰。久雨或大雨后转晴，气温急剧升高，病情加重。