科属不同：三文鱼属于鲑属与鳟属溯河洄游性鱼类，大马哈鱼属于鲑形目、鲑科、太平洋鲑属冷水性溯河产卵洄游鱼类。
产地不同：三文鱼主要分布在太平洋北部、欧洲、亚洲、美洲的北部地区，大马哈鱼主要分布在太平洋北部和北冰洋中。
形态区别：三文鱼体型侧扁，背部隆起，银灰色，肉为粉红色且有弹性，大马哈鱼体长60厘米左右，体型似纺锤型，尾鳍深叉，吻端突出，微弯，口裂大。
一、科属不同
1、三文鱼
三文鱼为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、辐鳍鱼纲、新鳍亚纲、鲑形目、鲑科、鲑属与鳟属溯河洄游性鱼类。
2、大马哈鱼
大马哈鱼为动物界、脊索动物门、脊椎动物亚门、硬骨鱼纲、辐鳍亚纲、鲑形目、鲑科、太平洋鲑属（大马哈鱼属）冷水性溯河产卵洄游鱼类。
二、产地不同
1、三文鱼
三文鱼别称北鳟鱼、大马哈鱼、罗锅鱼、马哈鱼、麻糕鱼等，主要分布在太平洋北部及欧洲、亚洲、美洲的北部地区，主要种类有挪威三文鱼、芬兰三文鱼、美国三文鱼、大马哈鱼等。
2、大马哈鱼
大马哈鱼别名北鳟鱼、大发哈鱼、罗锅鱼、马哈鱼、麻糕鱼、大麻哈鱼等，分布于太平洋北部和北冰洋中，主要有大马哈鱼、驼背大马哈鱼、红大马哈鱼、大鳞大马哈鱼、孟苏大马哈鱼、银大马哈鱼等种类。
三、形态区别
1、三文鱼
三文鱼的体型侧扁，背部隆起，齿尖锐，鳞片细小，银灰色，产卵期有橙色条纹，肉质紧密鲜美，肉色为粉红色并具有弹性，鳞小刺少。
2、大马哈鱼
大马哈鱼通常体长60厘米左右而侧扁，略似纺锤形，头后至背鳍基部前渐次隆起，背鳍起点是身体的最高点，从此向尾部渐低弯，头侧扁，吻端突出，微弯，口裂大，形似鸟喙，上下颌各有一列利齿，眼小，鳞也细小，作覆瓦状排列，脂鳍小，位置非常后，尾鳍深叉形。