增进土壤肥力：可以增加土壤中氮素来源，同时将难溶磷、钾分解转变为可吸收利用的磷、钾化合物。
制造、协助农作物吸收营养：可促进作物吸收养分，从而刺激、调节作物生长，促使作物生长健壮。
增强植物抗病和抗旱能力：可抑制病原微生物繁殖，从而减轻作物病害，同时微生物菌丝可增加水分的吸收，提高抗旱能力。
提高作物品质：可提高农产品品质，减少硝酸盐积累。
一、生物菌有机肥有什么作用
1、增进土壤肥力
施用固氮微生物肥料，可以增加土壤中的氮素来源；解磷、解钾微生物肥料，可以将土壤中难溶的磷、钾分解出来，转变为作物能吸收利用的磷、钾化合物，改善作物的营养条件。
2、制造和协助农作物吸收营养
根瘤菌侵染豆科植物根部，固定空气中的氮素。微生物在繁殖中能产生大量的植物生长激素，刺激和调节作物生长，使植株生长健壮，促进对营养元素的吸收。
3、增强植物抗病和抗旱能力
微生物肥料因为在作物根部大量生长繁殖，抑制或减少了病原微生物的繁殖机会；抗病原微生物的作用，减轻作物的病害；微生物大量生长，菌丝能增加对水分的吸收，使作物抗旱能力提高。
4、提高作物品质
使用微生物肥料后对于提高农产品品质，如蛋白质、糖分、维生素等的含量上有一定作用，有的可以减少硝酸盐的积累。在有些情况下，品质的改善比产量提高好处更大。
二、微生物菌剂冻了还有效果吗
1、微生物菌剂冻了（受冻）没有效果。
2、微生物菌剂通常在土壤中温度为18-25℃时生命活动活跃，温度升高时，生物菌活动会随着加剧，但温度过高时会失去活性。
3、温度降低时生物菌活动会随着减弱，在土壤中温度低于5℃时活动微弱，甚至开始进入休眠状态。