条锈菌夏孢子单胞，球形，表面有细刺，鲜黄色，孢子壁无色，具6～16个发芽孔。冬孢子双胞，棍棒状，顶部扁平或斜切，分隔处稍缢缩，褐色，上浓下淡，下部瘦削，柄短有色。
病原特征：菌丝丝状，有分隔，生长在寄主细胞间隙中，用吸器吸取小麦细胞内养料，在病部产生孢子堆。夏孢子单胞球形，鲜黄色，表面有细刺，大小（32～40）×22～29（um），有发芽孔6～12个。冬孢子双胞，棍棒形，顶部扁平或斜切，分隔处略缢缩，大小36～68×12～20（um），柄短。
小麦条锈病主要发生在叶片上，其次是叶鞘和茎秆及穗部。苗期染病，叶片上产生多层轮状排列的鲜黄色夏孢子堆。成株叶片初发病时夏孢子堆为小长条状，鲜黄色，椭圆形，与叶脉平行，且排列成行，像缝纫机轧过的针脚一样，呈虚线状，后期表皮破裂，出现锈被色粉状物，用手触摸病斑，就在手上留下锈粉。
真菌菌丝丝状，有分隔，生长在寄主细胞间隙中，用吸器吸取小麦细胞内养料，在病部产生孢子堆。夏孢子单胞球形，鲜黄色，表面有细刺，大小（32～40）×22～29（um），有发芽孔6～12个。冬孢子双胞，棍棒形，顶部扁平或斜切，分隔处略缢缩，大小36～68×12～20（um），柄短。