一、反应堆建造方法和注意事项
（1）行下内置式反应堆操作时间：晚秋、冬季、早春建行下内置反应堆，如果不受茬口限制，最好在作物定植前10～20天做好，浇水、结合施疫苗、打孔待用。晚春和早秋可现建现用。
（2）行间内置式反应堆操作时间：一般在8月底、9月上旬定植比较早的作物，如西红柿、菜椒等，11月下旬到12月上旬操作较适宜。
（3）行下内置式反应堆操作方法：在小行（定植行）位置，顺南北方向挖一条略宽于小行宽度（一般70厘米）、深20厘米的沟（果树应把树冠下15～20厘米表层土扒到两边，以露出毛细根为宜），把提前准备好的秸秆填入沟内，铺匀、踏实，填放秸秆高度为30厘米，南北两端让部分秸秆露出地面（以利于往沟里通氧气），然后把150～200千克饼肥和用麦麸拌好的菌种均匀地撒在秸秆上，再用铁锨轻拍一遍，让菌种漏入下层一部分，覆土18～20厘米。然后，在大行内浇大水湿透秸秆，水面高度达到垄高的四分之三（果树应在扣棚提温前7天浇水）。浇水3～4天后，将提前处理好的疫苗撒在垄上，并与15厘米表土掺匀，找平垄，在垄上用12#钢筋打3行孔，行距20～25厘米，孔距20厘米，孔深以穿透秸秆层为准，等待定植。
（4）行间内置式反应堆操作方法：在大行间，顺南北向挖一条略窄于小行宽度（一般50～60厘米）、深15厘米的沟，将土培放垄背上，或放两头，把提前准备好的秸秆填入沟内，铺匀、踏实，高度为25厘米，南北两端让部分秸秆露出地面，然后把用麦麸拌好的菌种均匀地撒在秸秆上，再用铁锨轻拍一遍，让菌种漏入下层一部分，覆土10厘米。浇水湿透秸秆，然后及时打孔即可。
（5）注意事项：一是秸秆用量要和菌种用量搭配好，每500千克秸秆用菌种1千克；二是浇水时不要冲施化学农药，特别要禁冲杀菌剂，但作物上可喷农药预防病虫害；三是浇水浇大管理行，浇水后4～5天要及时打孔，用14号的钢筋，每隔25厘米打一个孔，要打到秸秆底部，浇水后孔被堵死要再打孔，地膜上也要打孔。每次打孔要与前次打的孔错位10厘米，生长期内保持每月打一次孔；四是减少浇水次数，一般常规栽培浇2～3次水，用该项技术只浇一次水即可，切记浇水不能过多。有条件的，用微滴灌控水增产效果最好。该不该浇水可用土法判断:在表层土下抓一把土用手一攥，如果不能攥成团应马上浇水，能攥成团千万不要浇水。而且，在第一次浇水湿透秸秆的情况下，定植时千万不要再浇大水，只浇小缓苗水；五是前2个月不要冲施化肥，以避免降低菌种、疫苗活性，后期可适当追施少量有机肥和复合肥（每次每亩冲施浸泡7～10天的豆粉、豆饼等有机肥15公斤左右，复合肥10公斤左右）。
二、应用反应堆技术与密度、品种的关系
应用反应堆技术大行要大（90～100厘米），小行适中（60～70厘米），株距适当缩小，总密度比常规降低10%～15%。一般早熟品种宜密，晚熟品种宜稀，早春作物宜密，即早熟品种取上限，晚熟品种取下限。
三、处理菌种和植物疫苗
（一）处理菌种：1千克菌种20千克麦麸，1千克麦麸0.8千克水，先把菌种和麦麸干着拌匀再加水，拌好后用手一攥，手缝滴水。
（二）处理植物疫苗：方法与拌菌种相同。由于植物疫苗用量少，为避免接种不均匀，每亩可添加100～150千克草粉和50千克饼肥。方法是：饼肥和草粉单独加水湿匀掺匀，到用手一攥手缝滴水的程度，再与用麦麸拌好的植物疫苗混匀，堆放10小时左右再摊簿8厘米，温度不超过50℃，7～10天后再用，期间要翻料2～3次，料上不要盖不透气的塑料薄膜。
（三）菌种和植物疫苗使用时有两点不同：一是应用地方不同，菌种是撒在秸秆上分解秸秆，而植物疫苗是接种在15厘米表土层内，防治土传病害和根结线虫（果树是先接种植物疫苗上面再铺放秸秆）。二是菌种可现拌现用，用不完摊放在背阴处第2天再用，而植物疫苗要提前处理。三是疫苗接种方法有穴接、条带接和环形根区接，不论哪种接法均要先将其与土壤充分混合后再定植，使其与根系密切接触。接种后浇小水，隔5～7天再浇次小水降温，促使疫苗快速进入植物机体，以免因高温造成失活。如当天接种不完，摊放于阴暗处，厚度8厘米，第2天继续使用。