番茄果实能否发育成正常果，主要取决于花芽分化的质量。通常番茄发芽后25～30天，2～3片真叶时，第一序花开始分化。35～40天第二序花开始分化，60天第三序花也开始分化，这时幼苗长至7～8片真叶，已现蕾或开花。上述过程在育苗期完成，当幼苗期1、2、3花序形成时遇低温、水分充足、氮肥多，致花芽过度分化，形成多心皮畸形花，果实则呈桃形、瘤形或指形等；如苗龄拉长，低温或干旱持续时间长，幼苗处在抑制生长条件下，花器易木栓化，后转入适宜条件，木栓化组织不能适应内部组织的迅速生长，则形成裂果、疤果或杆外露果实：因此冬春低温多雨年份畸形果较多，晚春或夏秋则较少。