玉兰软腐病主要危害玉兰假鳞茎及叶片。茎基发病先出现水渍状小斑点，逐渐扩大成淡褐色斑，蔓延到假鳞茎，使之组织腐烂呈软腐且有臭味。茎基病斑也可沿叶脉向叶片扩展，叶片初期呈水渍状斑，后迅速扩大出现腐烂呈半透明状，病斑周围有黄色晕，晕圈周围呈宽带状。严重时，全叶腐烂解体呈湿腐，以致植株死亡。
土壤消毒。在移植前先对栽花的盆土喷施消毒剂进行消毒，抑制病菌感染。同时对于用过的花盆和污染的工具也要用消毒剂消毒后再用。
农业防治。病枯枝及时剪除拔除销毁；定植和移栽时不要碰伤植株，以免伤口侵染；日常浇水不宜过多，要适量，使根茎保持干燥，以免根茎、鳞茎发生腐烂。
药剂防治。发病后用针对性的药剂+护树大将军进行喷施，消毒杀菌，抑制病情蔓延。并且虫害也会导致病害的发生，因此要及时防治虫害。