在绵腐病发病初期及时喷药防治，可选用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或72.2%霜霉威水剂400倍液，或72.2%普力克水剂400倍液，或68%精甲霜灵·锰锌颗粒剂300倍液，或72%霜脲·锰锌可湿性粉剂800～1000倍液，或77%氢氧化铜可湿性粉剂500倍液，或80%新万生可湿性粉剂800倍液，要着重喷布植株下部和地面。
①农业措施选用耐湿性强的品种。高畦栽培，覆盖地膜，或雨季来临前地面敷草，阻隔土中病菌从而减轻发病。雨后排水，做到地面无积水。及时绑架、整蔓，适度打掉植株下部老叶，增强通风透光，降低株间的湿度。及时摘收植株下部果实。②药剂放置发病初期可用25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液，或72%克露可湿性粉剂500倍液，或72.2%普力克水剂600倍液，或80%高铜尚湿性粉剂800倍液，或15%恶霉灵水剂500倍液。要着重喷植株下部和地面。
利用抗生菌，将人工培养的抗生菌施入土中能抑制病菌生长。如在瓜田施用枯草芽孢杆菌或哈茨木霉的培养物，以利土壤中拮抗微生物得到繁育，从而达到抑制病原菌生长之目的，可以收到防病增产的效果。
丝瓜绵腐病，主要从温度跟湿度上控制。
①选用绿旺、3号丝瓜、短度水瓜、长度水瓜等耐湿的品种。②育苗期及丝瓜长出3片真叶以前要注意防止幼苗猝倒病，具体方法参见黄瓜猝倒病。③定植时采用高畦或起垅种瓜，南方畦面做成龟背形，排水沟深约30～40厘米，防止雨后畦面积水，定植穴施入充分腐熟有机肥或酵素菌沤制的堆肥，丝瓜架棚要搭得高些，下垂的果实不要与地面接触，同时要注意通风，防止湿气滞留。北方要注意及时插架，前期少浇水，多中耕，棚室栽培时要注意放风、降湿。
苗期发病初期喷淋72．2%普力克水剂600～700倍液或58%甲霜灵锰锌可湿性粉剂500倍液、64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液、70%乙膦·锰锌可湿性粉剂500倍液、72%克露、克霜氰或霜脲锰锌（克抗灵）可湿性粉剂800～1000倍液。