苦瓜在种植之前要施足底肥，底肥可使用有机肥，比如腐熟稀薄的人粪尿、腐熟饼肥畜禽粪、绿肥等，跟土壤充分混合搅拌后使用。在枝叶生长时，一定要补充好氮肥，但是不能偏重施加氮肥。开花前一周增施磷钾肥，苦瓜长出也要再追施一次磷钾肥，能促进开花结果。还可以配合一些叶面肥，生长期喷施磷酸二氢钾2-3次。
苦瓜对土壤要求不严格，适应性较强，但仍以富含有机质、保水保肥力强的壤土上生长良好。结果期要求充足的氮、磷/钾肥。从微酸至微碱。
土壤：苦瓜对土壤的要求不太严格，适应性较广，南北各地均可栽培。一般以在肥沃疏松，保土保肥力强的土壤上生长良好，产量高。肥料：苦瓜对肥料要求较高，如果有机肥充足，植株生长粗壮，茎叶繁茂，开花结果多，品质好。特别是生长后期，若肥水不足，则植株衰弱，叶色黄绿，花果少，果实细小，苦味增浓，品质下降。因此及时追肥，特别在结果盛期要求有充足的氮磷肥。