每亩用5%井冈霉素水剂150～200毫升或25%粉锈宁（三唑酮）可湿性粉剂50～75克，30%爱苗15～20毫升/亩，均加水60～70千克粗雾喷于发病部位或稻株基部。
根据水稻品种特性，选择栽培密度，少施氮肥，增施钾肥。可以使用爱苗，拿敌稳药剂防治。
水稻纹枯病，品种不抗、密度过大、长期深水灌溉、病田连作，易发病,建议选高产抗病品种,田间注意控密控氮及合理水管理,均衡施肥,药剂防治用井冈霉素加戊唑醇或丙环唑或己唑醇或苯醚甲环唑等有效，根据地区气候，做好规律性防控。
水稻纹枯病的防治可在分蘖末期用噻呋酰胺，稀释3000倍液进行喷雾防治。公顷用量195～345毫升（亩用13～23毫升）。