病菌从根冠细胞间隙或表皮细胞进入分生组织细胞，通过木质部到达茎叶部分，破坏维管束组织。当土壤湿度低，温度达27-33℃时发病最重。
油菜枯萎病苗期在茎基部产生褐色或黄褐色病斑，严重时或土壤湿度低、气温高时叶片失水、卷曲至枯死。初花期前后茎杆出现隆起的和沟状的长斑，并造成落叶，根和茎的维管束有菌丝或分生孢子并为黑色粘状物所填塞，植株矮化、萎蔫、最后枯死。
此外该病还可通过雨水、灌溉水、肥料或种子传播蔓延。土温11～30℃、土壤湿度20%～60%均可侵染。高温、连阴雨天多、光照不足、幼苗抗性差易染病。