大蒜疫病病原真菌为葱疫霉，属鞭毛菌亚门真菌。病菌以菌丝体和厚垣孢子在病残体或土壤中越冬，次年初春条件适宜时，病菌孢子借助风、雨、灌溉水、雾气进行初侵染和再侵染。发生疫病的大蒜，鳞茎膨大和抽薹能力不足，进而影响产量和品质。连作地块、土质黏重，排水不良，易积水，施用未腐熟的有机肥，种植密度过大，田间郁闭，长期低温、阴雨连绵发病较重。
病菌以菌丝体和厚垣孢子在病株地下部分或在土壤中越冬，翌春条件适宜时病部产生孢子囊和游动孢子，游动孢子借风雨和灌溉水传播蔓延，进行初侵染和再侵染。温、湿度条件适宜，该病一旦发生，蔓延很快，短时间内可致全田毁灭。病菌喜高温、高湿条件。播期过晚危害严重。