辣椒立枯病的防治方法主要以农业防治和化学防治为主。首先精选苗床，培育壮苗，提高抗病力；化学防治种子包衣防病；再结合化学药剂进行防治。
1、与禾本科作物实行3-5年轮作。2、及时深翻，覆盖地膜，防止菌核萌发出土。对已出土的子囊盘要及时铲除，严防蔓延。3、进行土壤处理。4、药剂拌种。5.发病初期用800倍72.2%普力克水剂和50%福美双可湿性粉剂的混合液喷淋，50%利得可湿性粉剂800-1000倍液，30%苗菌敌可湿性粉剂800倍液，30%可枯星1500-2000倍液。每隔7-10天喷1次，酌情防治2-3次。