1.清除杂草。定植前,彻底清除温室内墙体、走道等处的杂草。不要棚室周围种植大量容易感染病毒病的蔬菜。2.。设置防虫网。在风口处设置50～60目防虫网,四周压实封严,防止蓟蚜虱成虫由露地作物转移进入温室。3.。烟剂熏杀。定植前1～2天,可用15%异丙威无木粉烟剂,于傍晚均匀分布点燃熏杀棚内的蓟蚜虱等小型害虫。4.。防止病虫苗进棚,苗子进棚前,要仔细检查苗盘,剔除病苗、抖掉栖息叶背的蓟蚜虱。
多菌灵或甲基托布津属于老杀菌剂。
辣椒病毒病使用化学药剂防治。
在传毒昆虫蚜虫、烟粉虱、蓟马为害初期可选用阿维菌素、乙基多杀菌素、印楝素等生物源农药，当害虫大量发生时选用吡虫啉、吡蚜酮、腚虫脒、噻虫嗪、呋虫胺、烯啶虫胺、高效氯氟氰菊酯等作为补充药剂交替使用，生产上常施用噻虫啉+螺虫乙酯、阿维菌素+螺虫乙酯、噻虫嗪+联苯菊酯、氯噻啉+高效氯氟氰菊酯等复配剂来杀死媒介昆虫，减少病毒传播。
辣椒的病毒病可用病毒灵、病毒A或烯酰吗啉等进行防治。