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根据本病的流行特点，消灭蚊子是控制、缩小、扑灭乙型脑炎的主要措施。但是，蚊子的繁殖力很强，孳生地分布很广泛，消灭蚊子的工作很艰巨，对猪防止叮咬有一定困难。在防蚊的同时，还需要进行预防注射，提高猪体的抵抗力。用乙脑弱毒疫苗对猪进行免疫接种，效果良好，一般在春季蚊子繁殖到来之前，对配种的公猪和母猪同时进行预防注射。
本病的防治方法要加强动物检疫和免疫接种，加强场所灭蚊消毒，治疗可用西药和康复猪血清，也可用中药清瘟解毒之剂。
