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选择抗病品种，轮作倒茬，增施腐熟有机肥提高植株抗病力，用药可选硫酸链霉素➕乙蒜素喷雾。
中耕除草时可选用除草剂进行除草，人工除草除草松土时动作要轻，避免造成胡萝卜肉质根部出现伤口而引起软腐烂根病害的发生。发现病苗时要及时拔出，并用草木灰或者石灰进行除菌消毒。胡萝卜软腐烂根病初期可喷洒72%农用链霉素可湿性粉剂4000倍液或者12%的绿乳铜乳油500倍液进行喷洒防治。一般情况下，喷洒2-3次即可防治，在采收前半月停止用药。
