鸡粪是一种优质的有机肥，其不仅含有丰富作物所需元素和有机质，而且还含有多种微量元素，是实现绿色循环生产的一种有效手段。但是，新鲜鸡粪不能直接施用，由于未经腐熟消毒的鸡粪，存有大肠杆菌与虫卵，很容易招致地下害虫，所以必须经过堆积腐熟消毒后才可使用。根据实际生产可采取以下五方法实现鸡粪无害化处理。
一是利用沼气池发酵法
可以在饲养场内建沼气池，一方面将鸡粪送于池内生产沼气，用于烧水煮饭等，另一方面沼气池中的粪肥清出池外后，用干制法或发酵法堆积贮存制成有机肥。
二是塑料膜密封发酵法
在粪场的粪堆上盖上塑料膜，周围密封不透气，留一端掀盖方便，将每天打扫的鲜鸡粪加入，再压实，反复一段时间后，粪即干成堆，如果长期不使用则最好用泥土封存。此法粪堆升温快，灭蛆好，适应范围广。
三是微生物发酵法
利用微生物或微生态制剂分解粪便中的臭素，10d后粪便无臭味，既提高生产效益，改善饲养环境，还可减少苍蝇孳生，效果很好。
四是高温堆肥法
将鸡粪运到较背风向阳的地方，浇一些开水，边浇水边搅拌，拌好后及时堆成堆，用塑料布或泥封平，经10～15d的高温消毒，腐熟即可使用。
五是药物处理法
在堆放干燥的鸡粪中加入10mg/kg的敌百虫，把敌百虫用热水浸开拌到鸡粪中发酵。在施用前，按50kg鸡粪对10g多菌灵比例拌匀，这样一来既可杀死地下害虫，还可消除鸡粪当中的病菌等有害物质。