按照保护土壤的要求科学消毒。
不同作物消毒方法不一样，果园可用石硫合剂。
(1)太阳能消毒在保护地黄瓜采收拉秧后，清洁田园，多施充分腐熟的有机肥料，而后把地深翻平整好。在7～8月份，气温达35℃以上时，用薄膜覆盖密闭好棚室，土壤温度可升至50℃～60℃，甚至更高，高温处理约1个月，就可大量杀灭土壤中的病原菌和虫卵以减轻下茬黄瓜土传病虫害的发生。(2)蒸汽热消毒是用蒸汽锅炉加热，通过导管把蒸汽热能送到土壤中，使土壤温度升高，杀死病原菌，以达到防治土传病虫害的目的。（3)药剂消毒在播种前，将药剂施入土壤中，其目的是防止种子带病和土传病虫害的蔓延。常用的药剂消毒方法有：①甲醛消毒法。②多菌灵消毒法。③百菌清消毒法。④波尔多液消毒法。