炭疽病的防治应重点选用抗病品种，调节室内湿度，使其降至70%以下，并抓好全生育期的保护。①选用抗病品种选用齐红、齐露、开杂2号、开杂5号、京欣、兴蜜。②种子消毒，培育无病壮苗。③实行轮作，合理施肥，减少氮素化肥用量，增施钾肥和有机肥料。④地面全面覆地膜并要加强通风调气，降低室内空气湿度至70%以下。⑤合理密植，科学整枝，防止密度过大，以降低室内小气候湿度。⑥科学使用杀菌农药。
西瓜炭疽病可以使用三环唑等喷雾防治。
炭疽病除了农业防治外，还可以药剂防治。在西瓜炭疽病发病初期，可用50%多菌灵粉剂400～600倍溶液，或者用25%三唑酮粉剂1000～1500倍溶液，或者用40%福美双粉剂600～800倍溶液，或者用50%苯菌灵粉剂1200～1500倍溶液，或者使用70%甲基硫菌灵粉剂800～1000倍溶液，或者使用75%百菌清粉剂400～600倍溶液等等药剂喷雾防治。也可使用2%抗菌素生物制剂200倍溶液，每周一次，连续用药2～3次。
选用优质抗病品种。合理轮作,避免连作，对种子、育苗土严格,培育无病健壮苗。
防治西瓜炭疽病应该用多菌灵和百菌清进行喷施防治西瓜炭疽病。
加强肥水管理及病虫害防治。
在西瓜炭疽病发病初期，可用50%多菌灵粉剂400～600倍溶液，或者用25%三唑酮粉剂1000～1500倍溶液，或者用40%福美双粉剂600～800倍溶液，或者用50%苯菌灵粉剂1200～1500倍溶液，或者使用70%甲基硫菌灵粉剂800～1000倍溶液，或者使用75%百菌清粉剂400～600倍溶液等等药剂喷雾防治。也可使用2%抗菌素生物制剂200倍溶液，每周一次，连续用药2～3次。
加强田间和水肥管理及时做好病虫害防治。
西瓜炭疽病也是西瓜的主要病害之一，一般在伸蔓期和花期开始发病，主要危害叶片径蔓还有果实，一般要求在蔓长度在50公分以上开始防治，每隔七天一次。
选择抗病品种，用杀菌剂喷施。