闭合程度区别：金钱龟缩到龟壳中，其甲壳完全封闭；石金钱龟缩到龟壳中，其龟壳上有四个孔。
外观区别：头部为蛇头形且头顶部有黄色菱形标志，背部有三条隆起的黑色纵线；石金钱龟头部为扁圆状且为橄榄绿色，背部只有一条明显黑线。
腹甲区别：金钱龟腹甲横断，由韧带相连；石金钱龟腹甲为黄色，且每块盾甲外侧有大墨渍斑。
一、闭合程度区别
1、金钱龟：金钱龟的头和四肢全部缩到龟壳里，其甲壳可以完全封闭。
2、石金钱龟：虽然头和四肢都能缩到龟壳中，但龟壳上有四个孔，不是完全闭合。
二、外观区别
1、金钱龟：头部为蛇头形且头顶部有黄色菱形标志，背部为棕黄或灰黑色，且有三条隆起的黑色纵线。
2、石金钱龟：头部为扁圆状，头顶平滑且呈橄榄绿色。
三、腹甲区别
1、金钱龟：腹甲横断，由韧带相连。
2、石金钱龟：腹甲为黄色，且每块盾甲外侧有大墨渍斑。
四、背甲区别
1、金钱龟：背甲边缘周围为金桔黄色。
2、石金钱龟：背甲扁平，为棕黄绿色或棕黑色，且有三条脊棱，后缘略呈锯齿状。
金钱龟头部呈蛇头形，头部又呈黄色或橄榄色，石金钱龟头部略微扁圆。 3、背部三线 金钱龟背部呈棕黄色或灰黑色，有明显三条隆起的黑色纵线，以中间的一条隆起最为明显和最长，故又被称为川字背龟。而石金钱龟没有该特征。金钱龟头部呈蛇头形，头部又呈黄色或橄榄色，石金钱龟头部略微扁圆。 3、背部三线 金钱龟背部呈棕黄色或灰黑色，有明显三条隆起的黑色纵线，以中间的一条隆起最为明显和最长，故又被称为川字背龟。而石金钱龟没有该特征。